细胞膜核内的一些生物学反复,比如V(D)J烷基化,并不一定是由碱基三维构象所转录,除此以外碱基区室(compartments)、等价相关结构域(topologically associated domains, 简称TADs)和线粒体末端(chromatin loop)等。TADs是由线粒体末端挤出(chromatin-loop extrusion)所演化成的,而这一反复依赖于圆末端形状的蜂窝蛋白复合物(cohesion complex)。与之来得应的是,蜂窝蛋白释放出来位点Wapl可以受到限制线粒体末端的延展(loop extension),从而起到负向转录的作用。
一系列免疫球蛋白的归因于,构成了体液免疫抵御外来微生物的主要成分,而免疫球蛋白的动植物,是由V(D)J烷基化所解决问题的,这一反复,依赖于Pax5所介导的2.8Mb窄免疫球蛋白重链(immunoglobulin hey chain,简称lgh)碱基的拉窄。然而在以前体B细胞膜(pre-B cells)中的,Pax5是如何转录lgh拉窄的,仍旧未知。
近日,来自奥地利Vienna Biocenter的Meinrad Busslinger研究组在Nature上发表一本书Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion的篇文章,阐明Pax5通过减缓Wapl,从而解决问题对lgh的转录。
因为线粒体末端挤出依赖于黏贴连蛋白复合物,所以,创作者首先研究在以前体B细胞膜中的,蜂窝蛋白复合物各组分的表达出来是不是引发变化。创作者推测,在RNA高度上,来得于其他各种类型的巨噬细胞膜,以前体B细胞膜和原B细胞膜(pro-B cell)的的Wapl高度缩水了四倍。蛋白高度也有相似的推测。这些结果暗示,黏贴连蛋白释放出来位点Wapl的缩水,很或许增高黏贴连蛋白在线粒体上的存留时间段。
有报道援引,Pax5可以转录lgh碱基拉窄,创作者接下来探讨,Pax5是不是可以不良影响Wapl在以前体B细胞膜中的的表达出来。创作者通过Pax5突变缺陷人体内推测,其会了Pax5的以前体B细胞膜,Wapl的mRNA高度增高了4~6倍。另外,以前体B细胞膜中的,Wapl上普遍存在2个Pax5联结碱基P1和P2,而在成熟的B细胞膜中的,联结碱基减少至1个(仅存P2)。这些结果所述,在以前体B细胞膜中的,Pax5可以减缓Wapl高度。
在P1敲除人体内中的,骨髓中的的B细胞膜生殖基本上停留在以前体B细胞膜阶段,这所述,B细胞膜生殖是均受Wapl上Pax5联结碱基P1所转录的。另外,通过VDJ测序,创作者推测,P1敲除的人体内,以前体B细胞膜中的VDJH的烷基化%-孝着减少。而在Pax5敲除人体内中的,也某种程度推测相似的现象,并且,Pax5人体内lgh碱基无法进行拉窄。这些结果所述,Wapl上的Pax5联结碱基P1可以减缓lgh线粒体末端挤出。
最后,创作者关注Pax5对Wapl的减缓,是不是会不良影响以前体B细胞膜整个碱基的结构。创作者推测,只有在B细胞膜生殖的早期阶段,Pax5可以不良影响黏贴连蛋白在线粒体上的就位时间段。并且,与正常的以前体B细胞膜比起,Pax5敲除人体内的以前体细胞膜和P1,P2敲除的以前B细胞膜,其TADs中的线粒体末端的演化成高度孝着减少;与此来得的是,邻近地区段的线粒体拉窄,从而演化成碱基间隔的高度,却大幅升高。这些结果所述,在原B细胞膜中的,Pax5的联结碱基P1所减缓的Wapl高度减少,引人注意不良影响了整个细胞膜的碱基结构。
综上所述,创作者推测,在以前体B细胞膜和原B细胞膜中的,Pax5可以减缓黏贴连蛋白释放出来位点Wapl的表达出来,从而延窄黏贴连蛋白在线粒体上的就位时间段,进而有助于线粒体末端挤出高度的升高。这一反复是通过Wapl上的Pax5联结碱基P1解决问题的。而且,Wapl表达出来高度的减少,可以引起碱基结构的全面性变化,这也是以前体B细胞膜中的引发高高度的V突变烷基化的或许原因之一。
值得一提的是,就在这篇Nature网易后的次日,先为稿本bioRxiv上在线发布新闻了来自耶鲁大学Frederich Alt科学实验一本书“Loop Extrusion Mediates Physiological Locus Contraction for V(D)J Recombination”的相似工作,某种程度展示出Wapl通过不良影响线粒体末端挤出不良影响突变烷基化的最重要作用。
原始出处:
Louisa Hill 1, Anja Ebert 1, Markus Jaritz 1, et al.Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion.Nature. 2020 Jul 1. doi: 10.1038/s41586-020-2454-y.
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